Přístroje
| Technique | Instrument | Responsible person |
|---|---|---|
| Analytical ultracentrifugation | Optima AUC | Jan Komárek |
| ProteomeLab XL-1 | Jan Komárek | |
| Isothermal titration calorimetry | Auto PEAQ-ITC | Jitka Holková |
| VP-ITC | Jitka Holková | |
| Surface plasmon resonance | Biacore S200 | Josef Houser |
| Multichannel | Josef Houser | |
| SPR Imaging | Josef Houser | |
| Bio-layer interferometry | Octet RED96e | Josef Houser |
| Microscale thermoforesis | Monolith NT.115 | Eva Paulenová |
| Monolith NT.115 Pico | Eva Paulenová | |
| Size exclusion chromatography | OmniSEC | Josef Houser |
| UV-VIS spectroscopy | BioSpectrometer kinetic | Josef Houser |
| Circular dichroism | Chiroscan V100 | Josef Houser |
| Differential scanning calorimetry | Auto PEAQ-DSC | Josef Houser |
| VP-DSC | Josef Houser | |
| Differential scanning fluorimetry | Prometheus NT.48 | Eva Paulenová |
| Dynamic light scattering | DelsaMAX core | Tomáš Klumpler |
| SpectroLight 600 | Tomáš Klumpler | |
| Small-angle X-ray scattering | SAXS 2000 | Tomáš Klumpler |
| Cell sorting | CytoFLEX | Eva Paulenová |
| Imaging system | Odyssey M (temporary) | Jan Komárek |
| Pipetting robotics | sciFLEXARRAYER | Jan Komárek |
| Pipetting robotics & Crystallization | epMotion | Jana Kosourová |
| Phoenix | Jana Kosourová | |
| Dragonfly | Jana Kosourová | |
| Mosquito | Jana Kosourová | |
| Temperature-controlled crystallization | TG-40 | Josef Houser |
| Crystal plate storage and inspection | SpectroQ (20°C) | Jana Kosourová |
| SpectroQ (4°C) | Jana Kosourová | |
| X-ray diffraction | XtaLAB Synergy + Actor | Jaromír Marek |
Visit our labs from your chair - try the virtual tour!
Analytická ultracentrifugace: ProteomeLab XL-I
Analytická ultracentrifuga Beckman Coulter ProteomeLab XL-I je vybavena absorbanční (rozsah vlnových délek 190 – 800 nm) a interferenční optikou a umožňuje provádět experimenty pomocí technik sedimentační rychlosti a sedimentační rovnováhy.
Pomocí analytické ultracentrifugace lze studovat např. proteiny, nukleové kyseliny, lipidy, polysacharidy, viry nebo nanočástice. Analytická ultracentrifugace má široké uplatnění a může být využita např. pro určení homogenity vzorku, studium agregátů, stanovení oligomerního stavu proteinu (respektive molekulové hmotnosti částice) nebo pro studium interakcí biomolekul (stanovení stechiometrie interakce a afinity).
Plně automatický přístroj AutoITC200 je izotermální titrační kalorimetr s objemem měřící cely 200 ul. Pomocí metody ITC je možné studovat (bio)molekulární interakce jako například interakce malých molekul, proteinů, protilátek, nukleových kyselin, lipidů. Pomocí této metody může být studována enzymová kinetika, biologická aktivita látek nebo strukturní změny. Z jednoho měření lze získat kompletní termodynamický profil interakce – stechiometrii, Ka, ∆H and ∆S).
VP-ITC je izotermální titrační kalorimetr s pracovním objemem cely 1400 ul. Izotermální titrační kalorimetrie se používá pro charakterizaci biomolekulárních interakcí malých molekul, proteinů, protilátek, nukleových kyselin, lipidů a ostatních. Během jednoho experimentu je možné získat kompletní termodynamický profil (stechiometrie, Ka, ∆H and ∆S).
Kalorimetrie: Auto PEAQ-DSC
PEAQ-DSC je diferenciální skenovací mikrokalorimetr, jehož vzorkové kapiláry mají objem <200 µl. Technika DSC je založena na měření rozdílu tepelných změn doprovázejících kontrolované zahřívání nebo ochlazování vzorku (bio)molekuly a odpovídajícího referenčního roztoku. Automatizovaná verze přístroje PEAQ-DSC umožňuje měření až 282 vzorků v řadě.
VP-DSC je diferenciální skenovací mikrokalorimetr s objemem vzorkové cely 500 µl. Technika DSC je založena na měření rozdílu tepelných změn doprovázejících kontrolované zahřívání nebo ochlazování vzorku (bio)molekuly a odpovídajícího referenčního roztoku.
Diferenciální skenovací fluorimetrie: Prometheus NT.48
Prometheus slouží pro charakterizaci teplotní nebo chemické denaturace proteinů a jejich agregace v jediném běhu v rozsahu až (15 - 110 °C). Během jednoho měření je možno analyzovat až 48 vzorků.
Microscale thermophoresis: Monolith NT.115
Přístroj Monolith měří rovnovážnou vazebnou konstantu pro různé molekuly - tím umožňuje měření širokého rozmezí interakcí od vazby iontů až po interakce velkých komplexů (lipozomy, ribozomy).
Microscale thermophoresis: Monolith NT.115 Pico
Přístroj Monolith měří rovnovážnou vazebnou konstantu pro různé molekuly - tím umožňuje měření širokého rozmezí interakcí od vazby iontů až po interakce velkých komplexů (lipozomy, ribozomy). Monolith NT.115 Pico umožňuje analýzu vysokoafinitních interakcí a to až do pikomolární oblasti.
Biolayer interferometry : Octet RED96e
Biosensor Octet používá technologii BLI (biolayer interferometry) pro analýzu intertakce molekul (kinetiku, afinitu) na povrchu biosenzoru. Octet RED96e umožňuje paralelní měření až na 8 kanálech současně. Tento systém je vhdodný zejména pro interakce protein-protein a protein-nukleová kyselina, nicméně jej lze použít i pro další interagující systémy.
Rezonance povrchového plasmonu: BiaCore T200
Vysoce citlivý a teplotně stabilizovaný SPR biosensorový systém pro monitorování biomolekulárních interakcí v reálném čase bez nutnosti značení biomolekul. Pomocí SPR sytému T200 lze získat informace o kinetice, affinitě, koncentraci, specifitě, selektivitě a termodynamice biomolekulárních interakcích a tato metoda tak může být použita v různých oblastech od základního výzkumu po výzkum bioterapeutik a léčiv. V principu, jeden z vazebných partnerů je imobilizován na povrchu biosenzoru a druhý je přítomen volně v nánášecím pufru.
Rezonance povrchového plasmonu: Imaging system
Vícekanálový (až 36 kanálů) SPR biosensorový systém pro afinitní studie biomolekul, s modifikovatelným designem fluidního systému umožňující paralelní analýzu několika vzorků.
Dynamický (statický) rozptyl světla: DelsaMax Core
Dynamický rozptyl světla (dynamic light scattering) se používá pro analýzu proteinových roztoků, agregátů, inhibitorů, pufrů, nanočástic, polymerů či jiných látek v roztoku. DLS systém měří polydisperzitu vzorku a hydrodynamický poloměr (velikost) částic, a to v rozsahu 0.4 až 5000 nm. Toho se využívá např. při charakterizaci vzorku před krystalizací či jinými experimenty.
Dynamický rozptyl světla: Xtal SpectroLight 600
Dynamický rozptyl světla (dynamic light scattering) se používá pro analýzu proteinových roztoků, agregátů, inhibitorů, pufrů, nanočástic, polymerů či jiných látek v roztoku. SpectroLight 600 provádí měření v submikrolitrových kapkách v destičkách. To znamená malou spotřebu vzorku a umožňuje také např. přímé měření vzorku v krystalizační kapce.
Cirkulární dichroismus: Chiroscan V100
CD spektrometr Chiroscan V100 je schopný měřit cirkulární dichroismus, fluorescenci, totální fluorescenci, lineární dichroismus, magnetický dichroismus, optickou rotační disperzi a rovněž cirkulární dichroismus, fluorescenci.
Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS): CytoFlex SRT
The CytoFLEX SRT is a compact cell sorter designed to handle a wide range of samples commonly processed in a core facility. From bacteria to tumor cells and everything in between, the SRT provides the versatility needed to support the diverse research community.
Small angle X-ray scattering: SAXS
Rigaku's BioSAXS-2000 SAXS camera is designed specifically to meet the needs of the structural biologist. In standard experiment, the intensity of scattered X-rays is recorded from biological sample in solution. SAXS is used for determination of the integral structural parameters, shape reconstruction, determination of the oligomeric state in solution, unraveling the quaternary structure of protein complexes, modeling of molecular flexibility and more. The BioSAXS AUTO configuration incorporates an Automatic Sample Changer for unattended overnight operation.
Krystalizace: Robotika pro krystalizaci proteinů
"High-throughput" proteinová krystalizační stanice s pipetory pro práci s mikrolitrovými a nanolitrovými objemy tekutin, robotikou pro manipulaci s mnohajamkovými krystalizačními destičkami a příslušným řídícím SW+HW.
Krystalizace: Automatizovaný sklad a vizuální inspekce krystalizačních misek (4 °C and 20 °C)
Robotizovaný vysoce výkonný mikroskopovací systém pro skladování a plně automatizovanou inspekci a vývoj proteinových vzorků v UV a viditelné oblasti. Systém obsahuje plně integrovaný systém pro teplotně kontrolované skladování, inspekci a analýzu proteinových krystalizačních desek.
Centeo TG40 je systém určený pro teplotní optimalizaci krystalizace biomolekul.
Single crystal X-ray diffraction
Rigaku OD (Oxford Diffraction) XtaLAB Synergy Custom with robotics ACTOR, set of instruments optimized for "home lab" diffraction experiments with single crystals of macromolecules : proteins, nucleic acids, etc.
Microdeposition system for biosensor arrays
The sciFLEXARRAYER S1 is a compact automated non-contact dispensing system of ultra-low volumes. It consists of a piezo dispensing unit and precision equipment for liquid handling.
Mikrodepoziční systém pro biosenzorové arrays
SciFLEXARRAYER S1 je automatický bezkontaktní dávkovací systém určený pro přípravu biosenzorových arrays. Pomocí piezoelektrického jevu dokáže pipetovat velmi malé objemy kapalin.
